分子是構成物質的基本單位。由于物質分子的質量、排列方法和排列方式不同，分子的結構也不同，因而單一的種物質都擁有特定的振動頻率。換句話說，分子會不斷地以固定的頻率伸縮或者不停地變換角度。物質經紅外線照射后，都會產生共鳴和吸收；由于物質的分子結構狀況不同，因此能顯現出各具特色，而且有專一的紅外線吸收光譜。

       由于遠紅外線與人體的振動頻率接近，能夠深入皮膚和皮下組織?！吧獠ā睗B入體內之后，會使體內水分子振動，分子之間摩擦生熱使皮下溫度上升，加速血液循環，強化免疫系統，對于血液微循環障礙引起的多種不適均具有幫助。

       此外，身體內的一些有害物質，例如食品中的重金屬和其它有害物質、乳酸、游離脂肪酸、脂肪和皮下脂肪、鈉離子、尿酸、積存在毛細孔中地化妝品殘余物等，能夠藉助代謝的方式，不用透過腎臟，直接從皮膚和汗水一起排出，可避免增加腎臟的負擔。

       一般來說，燃料燃燒、電熱器具熱源等放出的紅外線多屬于近紅外線，由于波長較短，因此產生大量的熱效應，長期照射人體后會產生灼傷皮膚及眼睛水晶體等傷害。波長較短的其它電磁波如紫外線、X射線及γ射線等，會使原子上的電子產生游離，對身體有傷害作用。遠紅外線則不然，由于波長較長，能量相對較低，所以在使用時發生燙傷的危害會相對較少。

       遠紅外線和家用電器所放射出的低頻電磁波不同，家用電器所釋出的低頻電磁波可穿墻透壁及改變人體電流的特性，而被人們懷疑其危害性。遠紅外線在人體皮膚的穿透力有0.011至0.1厘米，而且人體本身也會放出波長約9微米的遠紅外線，它和低頻電磁波不可混為一談。

       遠紅外線被用在許多身體不適的輔助上，例如筋骨肌肉酸痛、肌腱炎、燙傷及傷口不易愈合等疾，都可以利用遠紅外線照射能夠加速血液循環的特性，輔助恢復的目的。